Spring 2000

Miyu adalah gadis kelas 8, yang orang tuanya dipekerjakan oleh NASA. Mereka berangkat ke Amerika meninggalkan Miyu bersama Pak Saionji. Kemudian, Saionji memutuskan untuk pergi dalam perjalanan selama 1 tahun ke India meninggalkan Miyu sendirian dengan anaknya, Kanata. Komplikasi lebih meningkat saat bayi Alien dan pengasuhnya merawat hewan peliharaan di rumah mereka. Untuk memperburuk keadaan, bayi asing mulai memanggil Miyu dan Kanata Mom dan Dad, juga menunjukkan kekuatan ESP dan melayang-layang.

Taichi Yagami dan teman-temannya telah pindah ke SMP, tetapi pada saat itu, mereka telah kehilangan kontak dengan partner Digimon mereka. Taichi terkejut karena tiba-tiba menerima panggilan darurat memanggilnya ke Dunia Digital. Sesampainya di sana, ia mengetahui bahwa Digimon hidup dalam ketakutan akan Kaisar Digimon yang misterius, yang entah bagaimana menekan kemampuan mereka untuk Digivolve!

Di dunia nyata, Hikari Yagami dan Takeru Takaishi bersatu kembali di kelas lima yang sama. Mereka berbagi tiga teman sekolah: Daisuke Motomiya, yang mengingatkan mereka berdua tentang Taichi; Miyako Inoue, seorang penyihir teknis; dan Iori Hida, tetangga Miyako. Ketika ketiga anak ini menerima Digivices “D-3”, mereka — bersama Hikari dan Takeru, yang masih memiliki Digivices asli mereka sendiri — terdiri dari generasi baru “Chosen Children” yang harus menyelamatkan dunia sekali lagi. Dengan kekuatan Digi-Telur Lapis Baja, mereka harus menggagalkan rencana Kaisar Digimon untuk menyebarkan pengaruhnya ke seluruh Dunia Digital.